Faktor keterbatasan jumlah laboratorium dapat berdampak pada waktu pengobatan pasien yang lebih lama. Misalnya bila tak terdapat lab di daerah tempat tinggal pasien  maka harus dikirim ke daerah lain. 

Melalui BGSi, pemeriksaan lain juga dapat dilakukan untuk deteksi dini penyakit dan pencegahan penyakit degeneratif seperti kanker, stroke, jantung, diabetes, hipertensi dan demensia.

Saat ini BGSi sudah dilaksanakan di 9 rumah sakit (RS) yang menjadi rumah sakit rujukan sekaligus pengampuan nasional yakni:

1. RSUPN Cipto Mangunkusumo untuk penyakit metabolik terutama diabetes
2. RS Dharmais untuk penyakit kanker
3. RS Pusat Otak Nasional untuk penyakit stroke
4. RSPI Sulianti Saroso untuk penyakit menular tuberkulosis
5. RSUP Persahabatan untuk penyakit menular TB
6. RS Ngoerah untuk wellness and beauty
7. RS Sardjito untuk penyakit genetik/penyakit langka
8. RSJPD Harapan Kita untuk penyakit jantung
9. RSAB Harapan Kita untuk kesehatan ibu dan anak. 

Seluruhnya fasilitas di RS itu disebut telah dilengkapi dengan mesin-mesin sequencing yang mampu memproses ratusan sampel setiap minggu.

(ezr)